בעיות ההתנהגות בכלבים מהוות תחום נרחב המטופל על ידי מאלפים המתמחים בבעיות התנהגות והרופאים הוטרינרים כאחד. תפקידנו כרופאים וטרינרים לוודא כי אין סיבה קלינית(פתולוגית או פיזיולוגית) המהווה בעצמה גורם לבעית ההתנהגות הקיימת, דוגמת כלב המטפטף שתן בבית עקב חולשת סוגרים או יצור שתן מוגבר ומדולל כתוצאה מכשל כליות. מספר בעיות התנהגות נפוצות בכלבים: 1.נביחות לא רצויות. 2.קפיצה על אנשים, אורחים ובני הבית. 3.התנהגות תוקפנית, הגנה על אוכל, על צעצועים, תקיפת חיות אחרות ואנשים. 4.שולטנות בבית (דומיננטיות)-שולטנות על טריטוריה (כורסא שהכלב משתלט עליה), דומיננטיות כלפי בני הבית (ילדים או מבוגרים). והתנהגות "זיווג" על עצמים ואנשים בסביבתו. 5.חפירות בחצר. 6.התנהגות רדיפה- אחרי אופנועים, מכוניות ועוד. 7.בריחה מהבית. 8.הרס הבית וכרסום הרהיטים. 9.חרדות נטישה 10.חרדה מרעשים כגון רעמים או זקוקים. בעיות אלו מטופלות בד"כ בשילוב של טפול התנהגותי ורפואי כך למשל בנסיון לפתור בעיות של שולטנות בכלבים נשלב סירוס הזכר הדומיננטי ואילוף. לפעמים בעיות שלכאורה נראות לנו כבעיות התנהגות, דוגמת חפירות, רדיפה אחר מכוניות נביחות ובריחה מהבית, התקוטטות עם כלבים אחרים ועוד  הן בעצם פעולות נורמליות לחלוטין בעולם הכלבים.התנהגויות אלו אינן נוחות לנו ואנו נעזרים במאלפים בכדי לשלוט בדחפים והתנהגויות אלו. רבות מהתנהגויות ההרס נובעות מתסכול ודיכאון. הכלב הוא יצור חברותי כשהכלב מוצא עצמו מנותק מהחברה או משועמם הוא יפתח התנהגויות בעיתיות ולא רצויות (כמו לעיסת כפות הרגלים).עלינו להקפיד למלא את צרכיו של הכלב בפעילות גופנית מתאימה כגון טיולים ארוכים בחוץ ונשיאת משאות לשיפור התרגול בכלבי עבודה. יש לבחור מראש את הכלב המתאים בעבורכם, כך למשל כלבים מגזעי הציד כגון ויסלה, בורדר קולי ווימרנר, יזדקקו לפעילות גופנית רבה ואם אתם אינכם מהטיפוסים הספורטיביים ייתכן ותרצו כלבים פחות פעילים כדוגמת הפינצ'ר או הפודל.לא כל התנהגות בלתי רצויה נחשבת "נורמלית" עבור הכלב ואת רובן נתן לפתור על ידי אילוף וטפול וטרינרי מתאימים.ישנם מקרים קיצוניים שידרשו התערבות "פסיכיאטרית", למשל חרדה קיצונית בכלבים שייתכן והטפול בה יהיה בחלקו תרופתי-פסיכיאטרי.בחלק מהמקרים של בעיות ההתנהגות אנו לא נצליח להעלים לחלוטין את הבעיה אך נוכל להקל על חי הכלב והבעלים על ידי "החלשה" של הבעיה הקיימת. בבעיות התנהגות חשוב לזכור כי אין פתרונות פלא והטפול דורש הרבה סבלנות ואהבה.